Manner-Portugalin pohjoisosassa maa on vuoristoista, kun taas Keski-Portugalissa sisämaassa on tasankoja. Etelässä maa on kumpuilevaa tasankoa ja alueella sijaitsee laajoja maatiloja.

Manner-Portugalin korkein kohta Serra da Estrelan vuoriston Torre-huippu, joka yltää 1993 metrin korkeuteen. Se lienee Portugalin ainoa paikka, jossa on myös säännöllisesti mahdollista hiihtää. Portugalissa, lähellä Lissabonia, sijaitsee myös Manner-Euroopan läntisin kohta Cabo da Roca-niemeke.

Portugalissa virtaa kymmenen suurta jokea, joista puolet saa alkunsa Espanjan puolelta. Tajojoki (port. Tejo), jonka äärellä Lissabon sijaitse on maan suurin joki ja jakaa Manner-Portugalin kahtia erottaen vuoristoisen pohjoisosan ja tasankoisen eteläosan toisistaan. Pohjoisessa virtaa Minho, joka alkaa Espanjan Galiciasta ja muodostaa 74 kilometrin matkalta osan Portugalin pohjoisrajasta Espanjan kanssa. Porton ja Minhon välinen alue tunnetaan vihreistä viineistään (port. Vinho verde).

Douro saa myös alkunsa Espanjasta ja virtaa Portugalin halki Porton kaupungin kautta Atlantin valtamereen. Douro-joen laakso on tunnettu Portviinin tuottajistaan. Eteläosan tärkein joki on Guadiana, joka virtaa pohjoisesta etelään ja muodostaa osan Espanjan vastaisesta rajasta.

Ilmastollisesti Portugali voidaan jakaa kolmeen vyöhykkeeseen: atlanttinen meri-ilmasto, mannerilmasto ja välimerenilmasto. Etelässä ilmasto on jonkin verran lämpimämpi ja kuivempi kuin pohjoisessa. Etelärannikon Farossa elokuun keskimääräinen ylin lämpötila on 28,8 °C ja sateisimman kuukauden joulukuun sademäärä 94 mm, kun taas pohjoisen Portossa elokuun ylin on 25 °C ja kuukausia, jolloin sataa yli 100 mm, on seitsemän.

Viimevuotiset sademäärät ovat olleet vähäisempiä ja siitä seurannut kuivuus on aiheuttanut laajoja metsäpaloja, joista mekin olemme saaneet lukea usein lehdistä.